А ты, когда проверял, трогал только опции ядра или еще и fstab?

P.S. Generic .config запости. Там наверняка в разделе с винтами, шинами и т. д. есть "десять различий". Угадывать - тупо, давай просто сравним.

===UP====
Эта строчка о чем:
#CONFIG_BLK_DEV_HD_IDE is not set

только в grub.conf =\
генерик??? это какой?

oops/ а в человеческом виде в menuconfig этот параметр где будет?

Generic - это ядро по-умолчанию, поставленное при инсталяции системы.
Не знаю, нашел его в твоем .config. Найди и отредактируй. Чем черт не шутит?

поставил CONFIG_BLK_DEV_HD_IDE=y
пересобрал - все тоже самое

а ты все таки так пробовал:
# zcat /proc/config.gz > /usr/src/linux/.config
# make oldconfig
# дальше собираешь ядро
.?
P.S. ты когда копируешь пересобранное ядро у тебя /boot примонтирован? а то в fstab'e он стоит как немонтируемый при загрузке! И новое ядро ты в grub.conf указываешь?

ннет еще. уже завтра. щас спать пойду
естественно монтирую.
да. заменяю просто vmlinuz.
ps вот ide.txt
ide.txt

можешь показать вывод команды: # emerge -pv gentoo-sources ?
хочу с твоим конфигом по тестить.

Manual

нужно сделать следующие:
Заранее создать файл .config с содержимым: http://paste.org.ru/?jr1lh5
и скопировать на раздел/флеху/etc, также учитывай кодировку и тип переноса строк (если сохранить в винде через блокнот, то в лине будут непонятки с текстом!).
# USE="symlink" emerge =sys-kernel/gentoo-sources-2.6.28-r3
# ls -la /usr/src/linux -- должен указывать на linux-2.6.28-gentoo-r3
# cp <путь до .config файла>/.config /usr/src/linux/.config
# make && make modules_install
# mount /boot
# cd /usr/src/linux && cp arch/i386/boot/bzImage /boot/2.6.28-r3
Добавить в /etc/grub/grub.conf:
И в /etc/fstab замени строку /dev/cdrom на /dev/sr0.
# umount /boot && reboot
После должно работать, может не работать звук из-за того что я незнаю твоё обородувание

Если выше описанное не поможет, то если работает ядро собраное через genkernel нужно загрузьтся и сделать:
# cd ~ && lsmod > ./lsmod.log && lspci > ./lspci.log
И залить эти логи на paste.org.ru и кинуть сюда ссылки!

P.S. Я специально поставил ядро 2.6.28-r3 чтобы посмотреть как работает твой конфиг, сделал так:
# cp <your .config> /usr/src/linux-2.6.28-gentoo-r3/.config
# make oldconfig -- и на вопросы нажимал Enter (делал по дефолту)
После перезагрузки ядро увидело жесткий! Но после чистки и слабой конфигурации оно не видело винт! Поэтому я и создал рабочий конфиг и проверил, после компиляции все работало как часы!
Так что удачи!