За ответ все равно спасибо, но за это время уже сам разобрался. Если кому интересно будет, то есть такая прога GPSGate, которая устанавливается на кпк и позволяет, разделять GPS сигнал на несколько каналов, и каждый из каналов посылать на отдельную программу, и в том числе эмулировать канал через виртуальный порт на компьютер по usb, а там уже его должен определить софт для работы с GPS.