Ну, тут не всё так однозначно, как кажется. FreeBSD действительно по части стабильности и безопасности рулит, но заморочек с настройками хватает, особенно если руки не очень прям растут оттуда, где надо. Linux проще в плане драйверов и утилит, но иногда кажется, что стабильность страдает — везде свои плюсы и минусы. В итоге выбор зависит от того, что важнее: простота или железобетонная надёжность.