Во первых провайдер очень легко может установить что клиент использует тор это легко определяется по ip первого сервера в цепочке (все серверы тор открыты и доступны), кстати некоторые провайдеры блокируют трафик тор.
Во вторых, к примеру, если известно что пользователь посещает определенный узел то контролируя трафик можно расшифровать все запросы. В таком случае установка сервера тор услажнит работу контролирующих органов, тк трудно определить чей запрос идет с данного компьютера
В третьих ходят слухи что проэкт тор стал финансироваться с госбюджета
И в четвертых даже на оф.сайте тора написано предупреждение что система тор не дает 100% гарантии анонимности и конфедиальности