Не всегда дело в скрытых файлах. Простой пример. Флешка на гиг (т.е. 900 с хвостиком мегабайт). Файлов - семьсот мегабайт, места нет.
Всё дело в том, что много маленьких файлов занимают физически больше места, чем их размер.