1) Нет, зависит от способа запуска.

2) Нет, хотя есть средства для этого, но если будешь так делать - то сам себе злобный буратино.
Почитай лучше умные книжки по проектированию.
Погугли Mvc, шаблонизатор и остальные умные слова.

3) Нет. Сейчас не 90е. И 90е больше не наступят.
Хотя находятся отдельные личности, которые его юзают и в вебе.