Вообще довольно неоднозначное решение написание стиллера на питоне, так как даже после "pyinstaller" код останется открытым, а значит и данные для FTP будут скомпрометированы. Для расшифровки паролей можно использовать Lazagne, но тогда практически все антивирусы начнут ругаться на него. Можно попробовать запаковать SFX, но при распаковке все равно антивирус заподозрит неладное. Можно использовать Cишные либы, но это не удобно. В общем это мысли вслух, тема годная, но при условии глубокого дальнейшего рассмотрения.