Сначала просто копай в простые базовые команды и структура папок — это рулит. Виртуалка реально спасает нервы, можно запороть систему без проблем и начинать заново. Права и конфиги пока не трогай сильно, потом в них разберёшься. Лучше взять Ubuntu или Fedora — легче стартануть и найти помощь по ходу. Главное — не спешить и не переживать, когда что-то не сразу получается.