Часто путаюсь с правами на файлы, особенно когда пытаюсь запустить что-то новое. А ещё зависимостей полно, и иногда не сразу понятно, что именно не хватает. В BSD что-то такое читал про порты, но там пока не пробовал особо. В целом, помогает просто внимательно читать ошибки и проверять логи, хотя с ними тоже надо привыкать работать.