Раньше вообще часто просто закрывали нужные страницы через robots.txt и всё, гугл не видел контент и не понимал, что там каноникал стоит. Теперь хотя бы поняли, что canonical — это метка, а robots.txt — запрет. Когда закрываешь страницу в роботе, поисковик и сам туда не полезет, и каноникал не сработает. Так что правильно ставить canonical и не мешать роботам лазить, тогда всё ок будет.