Честно, базовые вещи — фильтрация ввода и ограничение попыток — уже здорово снижают риски. Подготовленные запросы от SQL-инъекций не спасают, если по другим местам лазить, но это точно нужно. Капча и 2FA — круто, но для простого сайта можно и без них, если следить за логами и ставить блокировки по IP. Главное — не делать всё на отвали и не пускать без контроля попытки перебора.