Начинай с простого — базовые команды и структура папок, реально без этого никуда. Виртуалка или контейнеры точно помогут не угробить систему, лучше туда всё тестить сначала. На Ubuntu или Fedora спокойней, поддержка большая, ошибки проще разрулить. Права и конфиги оставь на потом, сначала просто привыкни к командной строке. Ошибки — норм, главное без паники и не спеши лезть в сложное.