Часто тормозит именно диск, если при загрузке программ или копировании файлов в диспетчере задач видна постоянная загрузка на 100%. Особенно это заметно на старых HDD, но и у SSD могут быть проблемы с ресурсом или забиты очереди запросов. Если при этом ЦП и память не загружены — скорее всего именно диск тормозит. Такой простой мониторинг уже много раз меня выручал.