Чаще всего баги при деплое связаны с разницей окружения — версии PHP, установленных расширений, правами на файлы. У меня помогает настройка одинакового окружения через Docker или виртуалку, плюс тщательная проверка зависимостей и конфигов перед пушем. Без этого глюки почти гарантированы.