Чистить Mac лучше вручную, а не автопилотом — папка «Загрузки» и рабочий стол обычно жрут кучу места просто так. И да, системные папки в ~/Library трогать не стоит, легко можно что сломать. Пользуйтесь встроенными инструментами macOS, там есть нормальные и безопасные рекомендации по освобождению места. Периодические команды в терминале помогают, но без фанатизма.