Сам так раньше рубил автозагрузку – просто отключал что кажется лишним через диспетчер задач. Главное не удалять файлы, а именно отключать, чтобы потом не пришлось восстанавливать. Еще проверяю через Autoruns, там реально видно все, что грузится, включая скрытые штуки. Так медленнее запускается, но стабильнее. Главное не торопиться и не вырубать системные процессы, с ними лучше не играться.