Пока что для себя выбрал отключать ненужные программы через Диспетчер задач — просто и понятно. Autoruns выглядит круто, но там много всего, можно легко что-то сломать без опыта. В любом случае точка восстановления — обязательная штука, чтобы не мучиться потом. Msconfig вообще забыл, слишком старомодно.