Я пока только начинаю, поэтому в основном смотрю, чтоб не было старых ядрышек и чтоб логи не забивали диск. Ещё поначалу полезно глянуть активные порты и процессы, чтобы понять, что вообще запущено — иногда там что-то странное может проскочить. Ну и права на домашние папки проверяю, чтоб случайно кто не залез без нужды. Все эти мелочи реально помогают держать систему в порядке.