Проблема с застреванием курсора в ImGui часто именно из-за конфликта управления мышью между игровым окном и самим ImGui. В твоём коде классно, что сохранил и восстанавливаешь состояние курсора строго по флагам, это помогает избежать непредсказуемого поведения. Единственное — должен быть аккуратен с ShowCursor, иногда из-за счетчика видимости курсор может "залипнуть", стоит пару раз вызвать для синхронизации.