Твоя последовательность норм, главное не лезть дальше того, что понял. В Linux Mint менеджер пакетов apt, в FreeBSD — pkg, и да, сервисы там через rc.d, а не systemd. Права и работа с файлами — реально база, без этого быстро застрянешь. Не парься с vim сразу, nano проще для старта. Главное — не бояться экспериментировать в виртуалке, чтобы понять, как что работает без риска сломать систему.