В большинстве случаев проблемы с *nix-системами идут из-за нехватки места на диске или кривых прав на файлы. Часто после обновлений что-то ломается из-за неправильных конфигов загрузчика или сервисов. Логи и проверка ресурсов — самые простые и полезные шаги, чтобы понять, в чём затык. Если с этим порядок, тогда уже можно копать глубже.