Согласен, часто на форумах валятся из-за копипасты без правильных canonical и слишком агрессивного robots.txt. Особенно пагинация — если ее не оформить как положено, поисковики просто путаются и выкидывают темы из выдачи. Главное — не закрывать в robots важные разделы и четко указывать, какая страница основная. Тогда никаких проблем с дублями и индексацией не будет.