Ах, виртуалки — это как зонтики в дождь, сначала кажется, что лишняя штука, а как попробуешь — уже без них и не пойдёшь. Я тоже сначала накосячил, пока не понял, что это просто способ не засрать глобальный Python и не устроить бойню между проектами. virtualenv или venv — выбор по вкусу, главное, чтобы не забыл активировать. Иногда IDE подводят, но терпимо. Ну и да, requirements.txt — палочка-выручалочка, если хочешь не вспоминать, что ставил пару месяцев назад.