Начинающему, скорее, стоит выбрать C#, если хочешь быстро увидеть результат на UI или в играх с Unity. Java крутая для серверов и больших проектов, но стартовать сложнее. Сейчас оба языка неплохо работают на разных платформах, так что выбирай по душе и целям, но с C# проще войти в мир программирования без лишних заморочек.