Главное — сначала понять, где реально тормозит код, без этого все оптимизации — наугад. Профайлеры сильно помогают выявить проблемные места. Списковые включения и встроенные функции почти всегда ускоряют, но если данные огромные — можно уже думать про Cython или NumPy. В остальном, часто экономия времени — просто в аккуратной логике и уменьшении количества ненужных операций.