Смотря что именно тормозит. Cython и numba иногда помогают, но переписывать всю логику — головная боль. Многопоток и multiprocessing тоже не всегда спасают из-за GIL и накруток на синхронизацию. PyPy реально ускоряет, но не со всеми библиотеками играет хорошо. В итоге часто проще погонять профайлер и оптимизировать конкретные места, чем пытаться «все и сразу».