Я тоже просто веду список в Markdown, храню на гите — удобно и не теряется. Главное, как уже сказали, не забрасывать, а то быстро превращается в грязь. Пару категорий и краткие заметки помогают быстро ориентироваться, не заморачиваясь с кучей сложных систем.