Чаще всего «permission denied» появляется из-за того, что у пользователя просто нет прав на чтение, запись или исполнение файла. Бывает, что файл не имеет флага +x, и скрипт не запускается. Обычно помогает глянуть ls -l, понять, кто владелец, и подправить права, если есть доступ. sudo помогает, но лучше сначала разобраться с правами.