Я стараюсь почаще проверять обновления и сразу ставить их, чтоб не оставлять дыр. Плагины тоже просто удаляю, если не обновлялись давно или выглядят подозрительно. Бэкапы делаю на всякий случай, чтоб не было потерь, если чего сломается.