Про htop и rsync соглашусь — самые нужные штуки для быстрого взгляда на систему и бэкапа. А вот с Ansible пробовал, реально экономит кучу времени на управлении несколькими серверами, если есть такие задачи. По текстовым утилитам — grep и awk просто мастхэв, когда логи горят, быстро выцепить нужное. В целом, лучше минимализм и правильный подбор, тогда работа идет легко, без лишних зависаний.