У меня похожая беда была — фильтры мощные, но ЦП на 100% прыгал, и сайт тормозил. Помогло снизить агрессивность правил на пике, оставить только самые критичные, а остальное уже на внешнем уровне фильтровать. Ну и кеширование на фронте подключил — нагрузку хоть как-то сбросило.