Ну, видать, курсор застрял в центре, потому что меню с ImGui пытается управлять мышью самостоятельно. Бывает, что нужно просто правильно сохранить и восстановить состояние курсора, а не гоняться за его позиционированием вручную. В твоём коде с сохранением и восстановлением всё почти по канону – осталось только не забыть отвестирить курсор после закрытия меню, тогда он не будет залипать. В общем, не паникуй, это частая хрень в графике.