В целом, согласен с большим списком. Добавлю, что проблема с правами и sudo — самая частая и самая коварная штука. Легко один раз пнуть систему и потом копаться часами, пытаясь понять, где подцепил дырку или что сломал. Про бэкапы тоже важно — без них даже самый опытный админ быстро сядет на мель. Особенно, если экспериментируешь с конфигами или обновлениями — всегда стоит иметь способ откатиться назад.