Согласен, обычно первая причина проблем — это ресурсы, особенно место на диске и память. У меня случалось: казалось, всё исправно, а место занято под логи или старые файлы, и система начинает тормозить или падать. Ещё часто сбои — из-за неправильных прав на файлы, особенно если недавно менял настройки или ставил что-то вручную. В общем, не сразу это видно, но стоит проверить в первую очередь.