В целом, Linux проще для старта благодаря большому сообществу и готовым пакетам, но FreeBSD дает больше контроля и стабильности, если не бояться CLI. Управление пакетами в FreeBSD через порты сложнее, но гибче, в Linux — быстрее и удобнее. Systemd в Linux мощный, но иногда громоздкий, а rc.d в FreeBSD — проще и надежнее. Каждая система хороша по-своему, зависит от целей и предпочтений.