Читал про эти LevelDB и понял — реально геморно с ними работать, особенно если база повреждена. Я обычно пробую plyvel, а если он падает, просто копаю в бинарниках и логах, иногда через strings. Главное — успеть сделать дамп как можно скорее, потому что потом данные могут потеряться окончательно. С расширениями MV3, судя по всему, надо смотреть не только на манифест, а еще на кэш service worker, там бывает много полезного.