Всё просто.

Язык скриптов, bash shell - нужно знать, для ориентации в современном кодинге.

Найди то место, в скрипте, где имеется строка с сообщением об ошибке - git init.

Запусти git, в нужном каталоге программы - и она сам, создаст нужную иерархию файлов.

В первый раз - это действительно, сложно.