Хорош метод. Все, что достаточно, это пропатчить модуль на php (mysql.so), perl (dbi::mysql), python (не помню) и что там еще у вас, где функция сразу кодировала строку запроса и после отдавала драйверу на обработку. ИМХО, решение имеет место быть, причем начнет действовать сразу и глобально без надобности переписывать весь код.