Какие именно?) То что программа сырая? Или то что как только автор ее доведет до ума она станет платной в том или ином виде?

По поводу сырости:

1. Позиции по сайтам берутся далеко не всегда правильные даже при тонкой настройке по FAQ.
2. При смене запросов (удалении и вставке новых) приложение в 30% случаев просто перестает реагировать на что бы то ни было. Спасает alt +F4 или Диспечер в винде
3. Отсутствие нормальной поддержки прокси
4. Отсутствие возможности задать интервалы проверки позиций
5. В последних версиях убрана кроссплатфоременность (лично я возлагал на надежды на линукс версию)
6. При проверке 3 - 4 больших проектов капча мамонта забивает.
7. отсутствует поддержка капчи рамблера (было такое пару раз, но тем не мение)

ИМХО.

По поводу того что программа станет платной у меня сомнений нет, просто, конверт в валюту может быть какой угодно.

А вообще автор программы молодец. Ему лично большой и жирный плюс в воображаемое личное дело.