Возможно при перезагрузке происходит изменение/удаление каких либо ключей реестра, что позволяет вновь использовать кряк...
Посмотри какие изменения в реестре происходят при запуске кряка, при перезагрузке и если что-то действительно происходит - пробуй проворачивать эти изменения рег файлом или батником...

Отслеживать изменения удобно софтиной RegShot