СТОП !!! Итак у нас исходник джумлы ну двига а что нам мешает взять его +немного даработать для бэкапа а ??? Будем пользоваться темеже скриптами (пхп) НО выполнять сваи мусиквиэл запросы,
еще вариант паискать в паблике скрипты для бэкапа джумлы, и прошерстить форумы по ее настройке
МММ вдагонку - паищи бэкапы баз сиквиэл