1.Разбей на 2 слова фразу. Можно игнорировать символы.
if ($key1+$key2 == substr($arr[$i],$l,$key_length) || $key2+$key1 == substr($arr[$i],$l,$key_length))
Как-то так. Вообще php я не очень знаю, было бы на ASP.net ))