ну... дак тяните вместе с кодом компилятор , канпелируйте на лету и будет счасте 8))
для обфускации матрицу исполнения шифруйте матрицей маскирования операций ...

...

а вообще для таких вещей и созданы эмбедед языки!!! Встраивайте и пользуйтесь!