Нашел тебе статью с примерчиком:
http://h8-self.livejournal.com/6590.html

ps. честно говоря я в pygtk не понимаю ничего)) просто сталкивался давно с такой проблемой на wxpython. так вот. возможно в твоем коде нужно вызвать метод gtk.gdk.threads_init()?