Один из главных механизмов – гипоксия (нехватка кислорода) во время сна. Механизм достаточно простой, если воздух перестает поступать в легкие во время остановки дыхания, а потребность в нем сохраняется на прежнем уровне, то содержание кислорода в крови, начинает постепенно снижаться.
Реагируя на снижение кислорода в крови, мозг дает команду на просыпание, тем самым, запускается второй механизм – фрагментация сна. Дело в том, что сон, в норме, имеет определенную структуру. Он состоит из нескольких фаз. И, если происходят частые пробуждения, то мозг не успевает погрузиться в более глубокие фазы сна. В тот самый период, когда хорошо расслабляется мускулатура, снижается артериальное давление, происходит выработка многих гормонов необходимых для нормального функционирования организма.

Частые пробуждения ведут и к активации, т.н. симпатической нервной системы. Резко возрастает частота сердечных сокращений, повышается артериальное давление, могут появиться различные нарушения ритма сердца.