Если на пингвинах нормально всё поставил (в частности wine), то советую юзать FASM очень удобный компилятор со стандартным синтаксисом (Intel) потому как сразу не привычно будет юзать линуксовые компиляторы с синтаксисом AT&T.
в нем сможеш компилить и под Win и под *nix

Единственное что не нравится в асме под линуксы, то для каждой версии линукса могут быть разные номера у системных вызовов.