cerber666 , необходимо чтоб скрипты писали компетентные люди. Код должен быть безопасным.
Но порой и этого мало, обычно на одном сервере хостится множество сайтов, через них тоже могут (да так в общем-то и делают ) проникнуть к тебе на сайт.
Ну и конечно же поддерживать ПО сервера в актуальном состоянии... следить за патчами и т.п., но и это не спасет от тех, кто имеет приватные сплоиты.
В общем не всё так просто, единственно что может спасти, это выдернуть из сервера питание