То же самое было когда у меня не было устнаовлено фаера. Поэтому фаер тут не причем...

Насчет http флуда вполне возможно, наблюдал частые подключения на 80 порт с одного айпи с кучи разных портов. Именно так я и вычислил его. Возможно дело в настройках apache?